1. Die Firmware in den Atmel schreiben. (Sorry kann zu AVR Studio nichts sagen)
2. Mit E2000 eine Logik erstellen und an das NET-IO Senden.

Wenn der Bootloader nicht richtig im Atmel ist wirst du die Logik nicht an das Board senden können da es nicht gefunden wird.

Eigendlich kann das alles über Die Software gemacht werden. Mit AVR Studio und einem STK500 haben wir das nie getestet.

Achte bitte auf die Fusebits sonst ist dein Atmel TOT.