Hallo n811e,
ich habe ja auch ioBroker parallel zu e2000Plus auf 2 Raspis laufen. Bei mir gibt es im Moment keine Probleme.
Was hast Du als letztes geändert?
Hast Du mal eine andere SD Karte neu aufgesetzt und ein Backup eingespielt?
Vielleicht hat die Karte einen schlag. Laufen viele Logger auf dem System?
Wie ist die Auslastung des Systems?
Es gibt viele Fragen. Würde es erst mal mit einer anderen SD-Karte probieren.

Viel Erfolg
Manfred